雜合性缺失(loss of heterozygosity, LOH),即一個(gè)位點(diǎn)上兩個(gè)多態(tài)性的等位基因中的一個(gè)出現(xiàn)缺失,是在腫瘤細(xì)胞中一種非常常見的DNA變異。很多癌癥的發(fā)生發(fā)展與一些染色體區(qū)帶上發(fā)生雜合性缺失(LOH)存在明顯的相關(guān)性,抑癌基因的雜合性缺失會(huì)導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生,利用STR的高度多態(tài)性檢測這些染色體區(qū)帶上的雜合性缺失有助于癌癥早期發(fā)現(xiàn),癌癥復(fù)發(fā)檢測等。
技術(shù)方法:
利用熒光標(biāo)記的PCR引物對(duì)懷疑存在雜合性缺失的區(qū)域內(nèi)多個(gè)微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行擴(kuò)增,然后采用高分辨率膠電泳(如用于測序的毛細(xì)管電泳等)對(duì)擴(kuò)增片斷進(jìn)行分離,通過熒光檢測系統(tǒng)(如ABI測序儀)確定擴(kuò)增片斷的長度,實(shí)現(xiàn)對(duì)微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)的分型,同時(shí)利用熒光毛細(xì)管電泳的精確定量性能可以較好的檢測雜合性缺失。如果某個(gè)位點(diǎn)是雜合子,可以根據(jù)比較癌旁組織和癌組織的兩個(gè)等位基因的峰高比來檢測是否存在缺失以及缺失的比例。也可以計(jì)算雜合性缺失的具體比例,實(shí)驗(yàn)過程也相對(duì)方便和快捷。另外,我們還可以在計(jì)算缺失比例時(shí)進(jìn)行修正,去除STR位點(diǎn)存在滑移現(xiàn)象的影響,使結(jié)果更加準(zhǔn)確。 應(yīng)用領(lǐng)域: 該技術(shù)廣泛的運(yùn)用于腫瘤基因組學(xué)的研究。
檢測對(duì)象:
癌旁組織和癌組織的樣本基因組DNA。 服務(wù)內(nèi)容:
檢測實(shí)例:
不發(fā)生和發(fā)生雜合性缺失的熒光毛細(xì)管電泳圖(上為癌旁組織,下為癌組織): |