適用于針對大通量SNP位點的分型項目,至少1000個以上樣本、300至數(shù)千個以上的SNP位點;對絕大多數(shù)SNP位點都具有很好的分型效果。
SNPseq®是由上海天昊生物科技有限公司自主專利開發(fā)的多重SNP分型專利技術。
技術原理: SNPseq®是由上海天昊生物科技有限公司自主專利開發(fā)的多重SNP分型專利技術。該技術能在一個檢測流程中同時實現(xiàn)300至數(shù)千個SNP位點進行分型。該技術基本原理是采用多重PCR對包含有待分型SNP位點的DNA區(qū)段富集,通過通用引物PCR擴增構建二代測序上樣文庫,最后通過Illumina® Hiseq高通量測序(500~1000X),結(jié)合二代測序數(shù)據(jù)分析獲取各個SNP位點的基因型。
高效快速:
每個反應可以實現(xiàn)數(shù)千個SNP位點分型檢測,同時可將上千個樣本標記混在一起檢測,1臺Illumina® Hiseq2500可以在3天之內(nèi)完成800萬個分型 ,而常規(guī)芯片只能單個或數(shù)個樣本同時檢測。 操作簡單: 1個連接反應,1個PCR反應,1次純化即可上機器,而常規(guī)芯片分型檢測操作繁瑣。 成本低廉: 同目前的SNP定制芯片相比,我們可以自行設計探針體系與試劑,基于二代測序技術分型,單個SNP分型成本很低。 準確性高: 由于連接酶識別特異性高,且非特異性連接產(chǎn)物可通過測序數(shù)據(jù)分析排除,大大提高數(shù)據(jù)準確性。
技術參數(shù):
SNP數(shù)量:300-數(shù)千 樣品數(shù)量:> 1000個 位點成功率:>95% Call rate:>98% 準確性:>99.8% 檢測實例 測序分型數(shù)據(jù): |