針對(duì)性的解決多個(gè)SNP位點(diǎn)(8-16個(gè))的基因分型項(xiàng)目,樣本量靈活,從幾百到上千個(gè)樣品。
技術(shù)方法:
我公司利用由美國(guó)Life Technologies公司開發(fā)的SNaPshot技術(shù),針對(duì)中等通量的SNP分型項(xiàng)目進(jìn)行了技術(shù)上的改進(jìn)大大提高了分型的通量和準(zhǔn)確性。SNaPshot又稱為小測(cè)序技術(shù),是在一個(gè)含有測(cè)序酶,四種熒光標(biāo)記的ddNTP,緊挨多態(tài)位點(diǎn)5’端的不同長(zhǎng)度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中,引物延伸一個(gè)堿基即終止,經(jīng)ABI測(cè)序儀跑膠后,根據(jù)峰的顏色可知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型。通過針對(duì)不同的SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)不同長(zhǎng)度的延伸引物來做到多個(gè)SNP在一個(gè)反應(yīng)體系中進(jìn)行分型,目前我們已經(jīng)可以做到15個(gè)位點(diǎn)同時(shí)分型通量。由于此方法為四色熒光標(biāo)記,所以可以針對(duì)各種SNP類型進(jìn)行分型,同時(shí)還可以對(duì)插入、缺失進(jìn)行分析。 技術(shù)體系的示意圖如下: 應(yīng)用領(lǐng)域: 本方法適用于多個(gè)涉及到SNP分型的遺傳研究領(lǐng)域。尤其適合針對(duì)全基因組SNP關(guān)聯(lián)研究獲得的初步陽(yáng)性位點(diǎn),以及全基因組測(cè)序得到的大量初篩突變位點(diǎn)進(jìn)行進(jìn)一步的大樣品驗(yàn)證研究。
檢測(cè)對(duì)象:
基因組DNA 服務(wù)內(nèi)容:
檢測(cè)實(shí)例:
樣本2, 基因型G/G 樣本3, 基因型G/A |