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候選區(qū)域排查

       在家系遺傳的單基因疾病中有些表型一致或者類似的疾病已經(jīng)有相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,所以為了經(jīng)濟(jì)有效的開展家系單基因疾病的連鎖研究,我們首先要在文獻(xiàn)報(bào)道的候選基因附近利用高度多態(tài)的STR位點(diǎn)為標(biāo)記進(jìn)行候選區(qū)域的排查,從而進(jìn)一步確定導(dǎo)致該疾病的基因和突變是否可能與已有的文獻(xiàn)報(bào)道一致。
 
技術(shù)方法:
候選區(qū)域的排查主要是利用熒光標(biāo)記的PCR引物對(duì)多個(gè)微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行擴(kuò)增,然后采用高分辨率膠電泳(如用于測(cè)序的毛細(xì)管電泳等)對(duì)擴(kuò)增片斷進(jìn)行分離,通過熒光檢測(cè)系統(tǒng)(如ABI測(cè)序儀)確定擴(kuò)增片斷的長(zhǎng)度,實(shí)現(xiàn)對(duì)微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)的分型。得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行家系連鎖分析,根據(jù)各個(gè)位置的LOD值肯定或排查候選基因。其主要特點(diǎn)為能檢測(cè)出倒位,大片段缺失等測(cè)序無法檢測(cè)出的情況,能快速方便準(zhǔn)確的確定導(dǎo)致該疾病的基因和突變是否可能與已有的文獻(xiàn)報(bào)道一致,為家系連鎖研究提供有利的證據(jù),并提示進(jìn)一步的研究策略方向。
 
應(yīng)用領(lǐng)域:
單基因突變導(dǎo)致的家系遺傳疾病;表型可以明確分辨;有一定數(shù)量的有效家系樣本個(gè)數(shù),根據(jù)資料已知可能導(dǎo)致該疾病的一些定位區(qū)域或者致病基因。
 
檢測(cè)對(duì)象:
家系個(gè)體的基因組DNA
 
服務(wù)內(nèi)容:
  1. 候選區(qū)域的STR位點(diǎn)的設(shè)計(jì)、合成和優(yōu)化
  2. STR分型實(shí)驗(yàn)。
  3. STR分型結(jié)果判讀。
  4. 根據(jù)家系進(jìn)行連鎖分析。
檢測(cè)實(shí)例:
COL1A1基因附近的4個(gè)STR位點(diǎn)分型圖:

 
連鎖分析結(jié)果:

 
 
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