適合于針對中等通量到大通量SNP位點(diǎn)的分型項(xiàng)目,至少800個(gè)以上樣本、48個(gè)以上的SNP位點(diǎn);對絕大多數(shù)SNP位點(diǎn)都具有很好的分型效果。
技術(shù)方法:
SNPscan®是由上海天昊生物科技有限公司自主專利開發(fā)的多重SNP分型專利技術(shù),能在一個(gè)檢測流程中同時(shí)實(shí)現(xiàn)對48/96/144/192個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分型。該技術(shù)基本原理是采用連接酶連接反應(yīng)的高特異性實(shí)現(xiàn)對SNP位點(diǎn)等位基因的識別,然后通過在連接探針末段引入不同長度的非特異序列以及通過連接酶加接反應(yīng)獲得位點(diǎn)對應(yīng)的不同長度連接產(chǎn)物,利用標(biāo)記熒光的通用引物對連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,通過熒光毛細(xì)管電泳對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳分離,最后通過對GeneMapper軟件分析獲取各個(gè)SNP位點(diǎn)的基因型。 應(yīng)用領(lǐng)域: 本方法可涉及到多個(gè)需要SNP分型的遺傳研究領(lǐng)域。適合對于大量候選生物通路或者候選染色體區(qū)域的基因SNP分型,尤其適合針對全基因組SNP關(guān)聯(lián)研究獲得的初步陽性位點(diǎn),以及全基因組測序得到的大量初篩突變位點(diǎn)進(jìn)行進(jìn)一步的大樣品驗(yàn)證研究。
◣高準(zhǔn)確性:檢測的準(zhǔn)確率可達(dá)99.9%;
◣高通量:以擁有1臺ABI3730XL為例,一天可以產(chǎn)生11萬個(gè)分型數(shù)據(jù); ◣低成本:檢測成本明顯低于其他中高通量SNP分型技術(shù); ◣高成功率:位點(diǎn)檢出率通常達(dá)95%以上,每個(gè)位點(diǎn)的平均樣本檢出率可達(dá)98%以上; ◣高效性:以96個(gè)位點(diǎn)2000個(gè)樣本為例,實(shí)驗(yàn)檢測體系構(gòu)建、優(yōu)化、檢測需8個(gè)周,及數(shù)據(jù)判讀需1個(gè)周。 ◣高靈活性:可根據(jù)客戶需求進(jìn)行設(shè)計(jì)合成Customer Design Panel及試劑盒,您只需擁有熒光毛細(xì)管電泳儀就可以輕松實(shí)現(xiàn)高效快速的SNP多重檢測技術(shù)。省去繁瑣的國外定制流程,更快速、更便宜 檢測對象: 基因組DNA 服務(wù)內(nèi)容:
檢測實(shí)例:
48個(gè)SNP位點(diǎn)分型截圖: 分顏色截圖(有Panel): |