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DNA甲基化克隆測序

       異常甲基化是癌癥中的普遍現(xiàn)象,還可能是腫瘤形成過程中最早出現(xiàn)的變化之一。另外,研究已經(jīng)表明 DNA 甲基化在基因印記、胚胎發(fā)育、x 染色體基因沉默和細(xì)胞周期調(diào)控中發(fā)揮關(guān)鍵作用。 
 
技術(shù)方法:
Bisulfite修飾后直接測序是由Frommer等 (1992)提出的DNA甲基化研究方法。該方法是首先使用Bisulfite修飾基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶都被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶則不變。設(shè)計引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物克隆測序,定量分析每個CpG島甲基化情況。 該方法優(yōu)點:可靠性及精確度高,能明確目的片段中每一個CpG位點的甲基化狀態(tài)。是目前新甲基化位點的尋找和基因特異位點甲基化的檢測最可靠方法之一。
 
應(yīng)用領(lǐng)域:
此方法廣泛應(yīng)用于腫瘤基因組學(xué)和疾病基因組學(xué)的研究。
 
檢測對象:
DNA樣本
 
服務(wù)內(nèi)容:
  1. DNA樣本的質(zhì)檢與標(biāo)化;
  2. 引物的設(shè)計、合成與優(yōu)化;
  3. DNA的Bisulfite處理;
  4. 目的CpG島擴(kuò)增,克隆及測序;
  5. 測序結(jié)果分析與整理。
測序結(jié)果分析:實驗專業(yè)甲基化分析軟件對測序序列進(jìn)行甲基化分析,可以得到如下數(shù)據(jù):
A. 測序序列與目的序列的相似度(%);
B. C-T轉(zhuǎn)化效率(%);
C. 目的片段中每個CG的甲基化情況(點狀圖);
D. 每個CG的甲基化率(%);
 

  A.點狀圖
 

B.同一樣本不同克隆測序圖

 
 
 
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