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Science:惡性眼癌的元兇基因

葡萄膜惡性黑色素瘤(maligment melanoma of uvea)是成年人中最多見的一種惡性眼內(nèi)腫瘤,在國外其發(fā)病率占眼內(nèi)腫瘤的首位,在國內(nèi)則僅次于視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤,居眼內(nèi)腫瘤的第二位。此瘤的惡性程度高,易經(jīng)血流轉(zhuǎn)移,在成年人中又是比較多見,在臨床工作中易和許多眼底疾病相混淆。

來自華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員利用外顯子組測序方法,找到了這種致命性眼癌的關(guān)鍵基因,這一研究成果公布在Science雜志上。由于這種癌癥轉(zhuǎn)移程度很高,因此要找到關(guān)鍵的基因并不容易,之前的研究發(fā)現(xiàn)這種癌癥涉及到調(diào)節(jié)蛋白降解的特別基因的缺陷,為了進(jìn)一步分析葡萄膜惡性黑色素瘤,研究人員采用了外顯子組測序方法,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在分析的31個腫瘤樣本中有26個(占84%)樣本在染色體3p21.1的位置上,有一個編碼BAP1蛋白(BRCA1-associated protein 1)基因存在體細(xì)胞失活突變,這些突變涉及未成熟蛋白的翻譯終止、影響泛素羧基末端水解酶(UCH)的結(jié)構(gòu)域等。BAP1蛋白可從蛋白質(zhì)上清除一種叫做泛素的化學(xué)加和物,而泛素常常會標(biāo)記在那些要被毀掉的細(xì)胞蛋白上。此次研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),BAP1信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路不但可作為葡萄膜黑色素瘤的一種治療目標(biāo),而且它還有可能作為其它具有高度轉(zhuǎn)移性的癌癥的治療目標(biāo)。

相關(guān)技術(shù):外顯子組捕獲、常規(guī)測序

點(diǎn)評:外顯子組序列捕獲區(qū)域包含合成蛋白質(zhì)所需要的重要信息,涵蓋了與個體表型相關(guān)的大部分功能性變異。與全基因組重測序相比,外顯子組測序只需針對外顯子區(qū)域的DNA即可,覆蓋度更深、數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性更高,更加簡便、經(jīng)濟(jì)、高效。同時,基于大量的公共數(shù)據(jù)庫提供的外顯子數(shù)據(jù),科學(xué)家們能夠結(jié)合現(xiàn)有資源更好地解釋研究結(jié)果。目前許多科學(xué)家都利用這一方法找到了致病基因,比如美國國家心肺血液研究所就從4名弗里曼謝爾登綜合征患者的DNA中準(zhǔn)確找出了致病基因變異。因此,外顯子組測序可針對連鎖排查沒找到病因的家系或散發(fā)病例進(jìn)行研究,并且需要足夠的科研經(jīng)費(fèi)投入。此次研究成果可能作為未來治療這種癌癥的靶標(biāo),并有可能作為其它具有高度轉(zhuǎn)移性腫瘤的治療靶標(biāo)。

文獻(xiàn):Frequent Mutation of BAP1 in Metastasizing Uveal Melanomas. Science. 2010 Nov 4.
Abstract: Metastasis is a defining feature of malignant tumors and is the most common cause of cancer-related death, yet the genetics of metastasis are poorly understood. We used massively parallel exome sequencing coupled with Sanger resequencing to search for metastasis-related mutations in highly metastatic uveal melanomas of the eye. Inactivating somatic mutations were identified in the gene encoding BRCA1-associated protein 1 (BAP1) on chromosome 3p21.1 in 26 of 31 (84%) metastasizing tumors, including 15 mutations causing premature protein termination and six affecting its ubiquitin carboxy-terminal hydrolase (UCH) domains. One tumor harbored a frameshift mutation that was germline in origin, thus representing a susceptibility allele. These findings implicate loss of BAP1 in uveal melanoma metastasis and suggest that the BAP1 pathway may be a valuable therapeutic target.

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