|
近日，美國(guó)加州大學(xué)伯克利分校、華大基因研究院、丹麥哥本哈根大學(xué)等單位合作的 “對(duì)200個(gè)人類外顯子的測(cè)序揭示大量低頻率非同義突變的存在”的 研究成果發(fā)表在新一期《自然-遺傳學(xué)》上。 Nature Genetics doi:10.1038/ng.680 Resequencing of 200 human exomes identifies an excess of low-frequency non-synonymous coding variants 研究概況：該項(xiàng)研究對(duì)200個(gè)丹麥個(gè)體蛋白質(zhì)編碼基因的外顯子組進(jìn)行了深度測(cè)序，發(fā)現(xiàn)了大量以往未知的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)（SNP），其中大部分在人群中都以較低頻率出現(xiàn)。該研究完成了目前在人類外顯子區(qū)域規(guī)模最大、分辨率最精細(xì)的遺傳圖譜，并以翔實(shí)的數(shù)據(jù)證明，人群當(dāng)中的低頻率多態(tài)性位點(diǎn)富集了大量能引起蛋白質(zhì)氨基酸序列改變的變異，而這類變異在人群中受到自然選擇作用，可能具有影響人類健康的功能。 專家點(diǎn)評(píng)：以往對(duì)多基因控制的復(fù)雜疾病所進(jìn)行的關(guān)聯(lián)分析研究盡管從理論上可行，并在實(shí)踐中發(fā)現(xiàn)了許多疾病關(guān)聯(lián)基因，但卻僅能解釋復(fù)雜疾病遺傳性的一小部分，這一現(xiàn)象被稱為“遺傳度缺失”，是當(dāng)前復(fù)雜疾病基因組研究的一個(gè)主要難題。該研究首次證實(shí)影響人類健康和疾病易感性的多態(tài)性位點(diǎn)在人群中往往頻率低，但是相關(guān)位點(diǎn)的個(gè)數(shù)很多。既往的復(fù)雜疾病關(guān)聯(lián)分析使用的基因分型芯片僅對(duì)常見多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)定，而無法研究低頻率多態(tài)性位點(diǎn)，從而漏掉大量疾病關(guān)聯(lián)位點(diǎn)造成“遺傳度缺失”。該研究不僅指出了目前主流疾病研究方法的缺陷，并顛覆性地提出疾病關(guān)聯(lián)分析應(yīng)充分使用測(cè)序技術(shù)而非基因分型技術(shù)，從而對(duì)改變科學(xué)家對(duì)復(fù)雜疾病的研究手段，推動(dòng)人類健康與醫(yī)學(xué)研究的進(jìn)步具有里程碑意義。該研究提示的CDRV理論傾向，對(duì)低頻CNV的研究以及全基因組測(cè)序進(jìn)行低頻突變檢測(cè)的研究方向都給給予強(qiáng)力的支持。 |
