背景信息:2010年美科學(xué)雜志公布十大科學(xué)突破:外顯子組測(cè)序位居第二,該方法利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測(cè)序。 孟德?tīng)柤膊。∕endelian disorders)例如囊性纖維化,鐮狀細(xì)胞病等,由單個(gè)基因發(fā)生突變引起,表現(xiàn)出孟德?tīng)栠z傳模式。一直以來(lái)追查此類(lèi)疾病的病因,主要方法是研究家族中的DNA遺傳模式,通過(guò)分析遺傳標(biāo)記的遺傳模式來(lái)定位致病基因。但是,如果患病的親屬有限,或者突變是自發(fā)出現(xiàn)的,那么這種所謂的連鎖分析就不奏效了。因此,對(duì)于7000種已知或可疑的孟德?tīng)柤膊?,只有不到一半能夠在基因水平得到解釋?/p> 這一僵局在2009年底,出現(xiàn)了轉(zhuǎn)機(jī)。隨著新一代測(cè)序費(fèi)用越來(lái)越低以及基因組定向捕獲工具的出現(xiàn),遺傳學(xué)家開(kāi)始能夠只對(duì)患者的外顯子組進(jìn)行測(cè)序。研究人員從樣品中分離出外顯子,然后將這些DNA送入測(cè)序儀,這大概會(huì)找到2萬(wàn)個(gè)突變。隨后,研究人員會(huì)通過(guò)生物信息學(xué)手段過(guò)濾掉那些不引起氨基酸改變的突變和常見(jiàn)突變。 研究成果:2009年9月,華盛頓大學(xué)的Jay Shendure及其同事在《Nature》雜志上發(fā)表了一篇原理驗(yàn)證文章。內(nèi)梅亨大學(xué)的研究人員也使用這種方法鑒定出Schinzel-Giedion綜合征中的致病突變。 前不久,《Science》雜志報(bào)道,華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員利用這種方法,找到了葡萄膜惡性黑色素瘤這種惡性眼疾的關(guān)鍵基因。 貝勒醫(yī)學(xué)院基因組測(cè)序中心也計(jì)劃對(duì)15種以上疾病進(jìn)行研究,包括腦癌、肝癌、胰腺癌、結(jié)腸癌、卵巢癌、膀胱癌、心臟病、糖尿病、自閉癥以及其他遺傳疾病,以更好地理解致病突變以及突變對(duì)疾病的影響。 研究領(lǐng)域:1、無(wú)法通過(guò)連鎖分析定位到致病基因的孟德?tīng)栠z傳??;2、復(fù)雜疾病; 技術(shù)手段:外顯子組測(cè)序;生物信息學(xué);
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