|
所有腫瘤細胞均來自于細胞基因組DNA序列和基因組修飾的異常。2005年，美國宣布啟動“腫瘤基因組計劃”。 該計劃預計在未來13年里找到肺癌、腦癌、卵巢癌等所有困擾人類癌癥的致癌基因元兇，從而診斷、治療這一“絕癥”。通過“腫瘤基因組計劃”，全球科學家希望協(xié)力逐一解開所有癌癥的秘密，進而建立一個共享數據庫。腫瘤基因組學的研究主要包括3方面的研究內容：
①惡性腫瘤易患性的遺傳背景。
②遺傳物質的變化或遺傳信息表達的異常同惡性腫瘤發(fā)生的關系。
③以遺傳學的方法分析環(huán)境中導致惡性腫瘤發(fā)生的因素。
腫瘤遺傳學的研究不僅可以為腫瘤的發(fā)生提供理論基礎，也可以為惡性腫瘤的診斷和防治提供線索。
傳統(tǒng)的研究方法主要側重于以下幾個方面。
1、通過染色體核型分析、熒光原位雜交(FISH)等方法觀察染色體結構改變。
2、通過對候選原癌/癌基因組織及癌旁組織測序進行突變分析。
3、采用微衛(wèi)星標記（STR）或者SNP芯片檢測（候選及全基因組）分析是否有雜合性缺失（LOH）。
4、表達譜分析。通過RT-qPCR分析候選基因的表達，或通過全基因組芯片對基因表達譜進行分析。
5、甲基化分析。利用限制性內切酶-Southern雜交法、亞硫酸氫鹽測序（Bisulfite Sequencing PCR, BSP）、甲基化特異性PCR(methylation specific PCR，MSP)的等方法分析候選基因的甲基化水平。 或者通過芯片分析全基因組甲基化水平。
6、MicroRNA分析。通過RT-qPCR分析候選基因的MicroRNA, 或者芯片分析全基因組，對于新microRNA采用大規(guī)?？寺y序的方法。
7、對于新轉錄子或者融合基因采用大規(guī)模分子克隆測序的方法分析。
近幾年建立起來的高通量二代測序技術為腫瘤遺傳學的研究提供了新的解決方案。以DNA為研究對象，可以進行全基因組測序（檢測基因突變、雜合性缺失LOH、拷貝數變異CNV、染色體結構等）、全基因組甲基化測序（表觀遺傳學分析）、全外顯子測序（檢測突變基因）等。以RNA為研究對象，可以進行microRNA譜分析、全轉錄組分析。
|
