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多基因遺傳病是指由多個微效基因累加共同作用，同時受到外界環(huán)境影響的遺傳疾病。常見的有代謝綜合癥、心血管疾病、皮膚病、自身免疫病等。由個體遺傳素質(zhì)和環(huán)境條件共同作用決定患多基因遺傳病的風險稱為易患性。由易患性所導致的多基因遺傳病的最低發(fā)病限度稱為閾值。在一定的環(huán)境條件下，閾值代表患病所必需的最低的易患性基因的數(shù)量。與環(huán)境因素相比，遺傳因素所起的作用大小叫遺傳度，用百分數(shù)表示。多基因遺傳病有以下特點：1、家族聚集傾向，但無明顯的遺傳方式。2、發(fā)病率同親緣級數(shù)成反比。3、發(fā)病率有種族差異。4、發(fā)病風險與家庭中患病人數(shù)、病情嚴重程度、是否近親婚配、性別等因素相關(guān)。
對于多基因遺傳疾病，研究目標主要是建立表型與人類遺傳物質(zhì)之間的關(guān)系，系統(tǒng)篩查和鑒定影響疾病發(fā)生風險和病程進展的基因多態(tài)性及易感基因，并評價其在疾病風險預(yù)測和早期預(yù)警中的應(yīng)用前景。由于多基因疾病外顯率很低，需要大量的可用信息才能觀察到關(guān)聯(lián)，也很容易錯失效應(yīng)較弱的基因，而且多基因疾病存在較強的遺傳異質(zhì)性，關(guān)聯(lián)關(guān)系在不同人群中難以得到重復(fù)。對于復(fù)雜疾病，關(guān)聯(lián)研究可以在未知連鎖的條件下，通過鑒定經(jīng)許多代數(shù)傳遞后仍保留完好的單倍型，檢測在一個群體中致病基因和等位基因的相關(guān)性。對多基因疾病進行定位可采取基于單個位點的關(guān)聯(lián)研究、基于候選基因的關(guān)聯(lián)研究、全基因組關(guān)聯(lián)研究（Genome Wide Association Study, GWAS）等策略。關(guān)聯(lián)分析中最常用的方法是病例-對照關(guān)聯(lián)研究。依據(jù)“常見疾病-常見變異（common disease-common variant, CD-CV）”假說，進行病例-對照關(guān)聯(lián)分析，主要采取GWAS，候選基因及通路基因SNP位點分析，基因拷貝數(shù)多態(tài)與疾病的關(guān)聯(lián)研究的方法。依據(jù)“常見疾病，罕見變異（common disease，rare viriants，CD-RV）”假說進行病例-對照關(guān)聯(lián)分析，主要采用全基因組拷貝數(shù)變異與疾病的關(guān)聯(lián)性，全基因組測序分析對照與病例的遺傳變異分布差異，全外顯子測序分析對照與病例的遺傳變異分布差異，候選基因外顯子稀有突變譜與疾病關(guān)聯(lián)性研究。
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