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英文題目：Changes in the Eye Microbiota Associated with Contact Lens Wearing 樣本信息： 58個(gè)個(gè)體（40名女性和18名男性）提供樣本，針對(duì)這些58個(gè)個(gè)體中的20個(gè)個(gè)體（包括9個(gè)眼鏡配戴者和11個(gè)非眼鏡配戴者）縱向隨訪6周，兩周收集一次樣品，在實(shí)驗(yàn)室共取樣3次。無(wú)菌干棉簽（Fisher Scientific）在以下采樣點(diǎn)進(jìn)行采樣，然后立即放置在無(wú)菌低溫管（thermoscientific）。取樣點(diǎn)包括左、右結(jié)膜；左、右眼下面的皮膚；隱形眼鏡（共250個(gè)樣本，其中包括116個(gè)結(jié)膜標(biāo)本，114個(gè)皮膚樣本，和20個(gè)隱形眼鏡部位樣本），樣品立即凍結(jié)在-80°C。
針對(duì)58個(gè)個(gè)體中另外38個(gè)個(gè)體（包括16個(gè)眼鏡配戴者; n =75）在眼科科室用50微升0.5%鹽酸丙美卡因滴眼液麻醉后都取樣一次。同時(shí)包括陰性對(duì)照組（n=3,沒(méi)有樣品）。
研究背景: 戴隱形眼睛已被確定為影響眼睛的一個(gè)危險(xiǎn)因素，如可以造成巨乳頭性結(jié)膜炎和角膜炎。而純培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)超過(guò)50%結(jié)膜拭子有細(xì)菌生長(zhǎng)，因此推測(cè)戴隱形眼鏡可能與微生物組變化相關(guān)。 研究結(jié)果： 每個(gè)樣本平均產(chǎn)生21,569個(gè)reads，所有樣本共產(chǎn)生11,750個(gè)OTUs。在實(shí)驗(yàn)室無(wú)麻醉取樣的受試者結(jié)膜細(xì)菌Alpha多樣性要比在眼科科室用眼藥水麻醉取樣的結(jié)膜細(xì)菌Alpha多樣性明顯較高（系統(tǒng)發(fā)育多樣性指數(shù)分析，圖1SA），使用麻醉眼藥水直接改變了細(xì)菌的菌落結(jié)構(gòu)組成（圖1SB）。
圖1SA.實(shí)驗(yàn)室結(jié)膜取樣和眼科科室結(jié)膜取樣的系統(tǒng)發(fā)育多樣性指數(shù)分析（左）和稀釋性曲線分析（右）
圖1SB.實(shí)驗(yàn)室結(jié)膜取樣和眼科科室結(jié)膜取樣的群落結(jié)構(gòu)分析柱狀圖，左圖為門水平，右圖為屬水平。 另外相對(duì)于不戴眼鏡，戴隱形眼鏡僅僅能夠引起眼科科室取樣個(gè)體微生物組較小變化（圖2S）。
圖2S.眼科科室結(jié)膜取樣的眼鏡配戴者和非眼鏡配戴者的系統(tǒng)發(fā)育多樣性指數(shù)分析（左）和稀釋性曲線分析（右） 在實(shí)驗(yàn)室共取樣得到250個(gè)樣本（包括116個(gè)結(jié)膜樣本，114個(gè)皮膚樣本，和20個(gè)隱形眼鏡部位樣本）。結(jié)膜樣本相對(duì)于眼睛下方的皮膚樣本或者隱形眼鏡樣本有較高的細(xì)菌alpha多樣性，而眼鏡配戴者和非眼鏡配戴者的結(jié)膜樣本間則沒(méi)有明顯的細(xì)菌alpha多樣性差異（圖1）。
圖1：眼鏡配戴者和非眼鏡配戴者的結(jié)膜樣本，眼睛下方皮膚樣本和隱形眼鏡部位樣本間細(xì)菌alpha多樣性比較。 非眼鏡配戴者眼結(jié)膜和皮膚相互兩個(gè)部位的微生物結(jié)構(gòu)相較于隱形眼鏡配戴者更不同，能夠明顯區(qū)分開(kāi)（圖2A和B）。同樣，眼鏡配戴者結(jié)膜和皮膚相互兩個(gè)部位的微生物結(jié)構(gòu)相較于隱形眼鏡配戴者更相似，不能明顯區(qū)分開(kāi)（圖2A和B）。然而，無(wú)論是通過(guò)個(gè)體還是通過(guò)采樣不同時(shí)間點(diǎn)都沒(méi)形成明顯的聚類（圖2A和B）。相對(duì)于非眼鏡配戴者，眼鏡配戴者眼部微生物有較高的個(gè)體間差異（圖2C和D）。
圖2:眼鏡配戴者和非眼鏡配戴者的結(jié)膜樣本，眼睛下方皮膚樣本和隱形眼鏡部位樣本間細(xì)菌β多樣性分析。 隱形眼鏡配戴者結(jié)膜的菌群結(jié)構(gòu)更類似于以前研究發(fā)現(xiàn)的人類皮膚菌群結(jié)構(gòu)，而與隱形眼鏡配戴者結(jié)膜的菌群結(jié)構(gòu)不同（圖3）。
圖3:結(jié)膜、皮膚，隱形眼鏡樣品和HMP數(shù)據(jù)庫(kù)樣本的菌群β多樣性分析。 相對(duì)于皮膚，非隱形眼鏡配戴者結(jié)膜的菌群結(jié)構(gòu)易受性別的影響（圖S5 A和B）。相對(duì)于男性個(gè)體，女性個(gè)體眼部微生物中不動(dòng)桿菌屬（Acinetobacter）和腸桿菌科（Enterobacteriaceae）的成員數(shù)目增加，而普氏厭氧球菌（Anaerococcus）減少（圖S5 C和D）。無(wú)論性別，與非隱形眼鏡配戴者相比，眼鏡配戴者的結(jié)膜菌群結(jié)構(gòu)與皮膚菌群結(jié)構(gòu)類似（圖S5E和F）。
圖S5:不同性別的結(jié)膜、皮膚和角膜接觸鏡樣本的細(xì)菌β多樣性分析 相比于非隱形眼鏡配戴者，隱形眼鏡配戴者的菌群主要富集在假單胞菌屬（Pseudomonas）、不動(dòng)桿菌屬（Acinetobacter）、甲基桿菌屬（Methylobacterium）、乳桿菌屬（Lactobacillus）。而在非隱形眼鏡配戴者，相對(duì)于結(jié)膜，這些菌屬都以較高豐度存在于眼睛下方皮膚樣本中（乳酸菌除外），表明這表明這些細(xì)菌可歸類為皮膚菌，而嗜血桿菌（Haemophilus）,奈瑟氏菌（Neisseria）,鏈球菌（Streptococcus）,葡萄球菌（Staphylococcus）,羅思氏菌（Rothia）,棒狀桿菌（Corynebacterium）則以較高豐度存在于非眼鏡配戴者結(jié)膜部位。相比于非隱形眼鏡配戴者,嗜血桿菌（Haemophilus）、鏈球菌（Streptococcus）、葡萄球菌（Staphylococcus）、棒狀桿菌（Corynebacterium）的豐度在隱形眼鏡配戴者中大大減少。相對(duì)于結(jié)膜，隱形眼鏡部位的不動(dòng)桿菌屬（Acinetobacter）和甲基桿菌屬（Methylobacterium）具有更高豐度（圖4）。
圖4:非配戴隱形眼鏡和眼鏡配戴者之間眼部微生物的相對(duì)豐度差異。 總結(jié)： ● 觀察到ME/CFS患者的微生物易位相關(guān)血液標(biāo)志物水平升高。LPS、LBP和sCD14在ME / CFS患者中水平均升高。LBP的水平和sCD14和LPS相關(guān)而LPS水平與sCD14相關(guān)。 亮點(diǎn): 像身體其它部位（如腸道、皮膚、嘴）一樣，眼睛也有一個(gè)正常的細(xì)菌群落，從而可以有效阻止外界的入侵者。然而，眼部微生物已經(jīng)在很大程度上被忽視，但是實(shí)際上它與眼睛健康，了解眼病及其相關(guān)功能息息相關(guān)，本報(bào)告發(fā)現(xiàn)眼鏡配戴者和非眼鏡配戴者之間的細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)有很大差異，本研究對(duì)探索微生物對(duì)隱形眼鏡配戴者的眼睛感染風(fēng)險(xiǎn)增加的作用提出了新的見(jiàn)解。 關(guān)于天昊： 天昊生物采用Miseq PE250測(cè)序策略對(duì)細(xì)菌16S rDNA區(qū)/真菌ITS區(qū)/真菌18S rDNA區(qū)的雙V區(qū)或多種單V區(qū)進(jìn)行測(cè)序，使用低循環(huán)數(shù)擴(kuò)增，保證每個(gè)樣品擴(kuò)增的循環(huán)數(shù)統(tǒng)一；采用特殊方法可有效避免系統(tǒng)內(nèi)誤差；數(shù)據(jù)質(zhì)量高，有效序列Q30達(dá)到80%以上；加上最新升級(jí)的分析內(nèi)容和解釋詳盡的結(jié)題報(bào)告，帶您享受極致的微生物擴(kuò)增子測(cè)序體驗(yàn)。
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