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如今微生物多樣性研究熱度持續(xù)高漲，而從大型微生物組的研究分析來看，人類微生物組所占的百分比最大，人類以及為人類服務的實驗動物的微生物相關研究共占據(jù)了全部研究的66%。
目前擴增子測序在人類健康相關疾病微生物研究中使用越來越廣泛，但是大家苦于找尋自己所研究疾病的相關擴增子測序文章，下面我們就盤點一下使用擴增子測序技術對各種疾病進行微生物研究的典型案例！
消化道疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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The pervasive effects of an antibiotic on the human gut microbiota, as revealed by deep 16S rRNA sequencing
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PLoS Biology
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4.587
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2008
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個人在服用環(huán)丙沙星前后糞便樣本
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細菌16S rDNA V3，V6區(qū)測序
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Towards the Human Colorectal Cancer Microbiome
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Plos one
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3.057
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2011
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來自6個接受了切除手術的原發(fā)性結腸腺癌患者癌組織和和癌旁粘膜樣品
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers
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The ISME Journa
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9.328
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2012
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46例結直腸癌患者和56例健康對照志愿者的糞便樣品
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細菌16S rDNA V3區(qū)測序
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Co-occurrence of driver and passenger bacteria in human colorectal cancer
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Gut Pathogens
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2.816
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2014
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正常腸道組織樣本（ｎ＝10），腺瘤性息肉組織樣本（ｎ＝10），腫瘤組織樣本（ｎ＝8）
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細菌16S rDNA V1-V2區(qū)測序
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Impacts of infection with different toxigenic Clostridium difficile strains on faecal microbiota in children
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Scientific Reports
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5.228
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2014
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28-48月大的14個 (CDAD A+B+)感染兒童，23個 (CDAD A–B+)感染兒童，43個健康兒童糞便
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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呼吸道疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Insights into the respiratory tract microbiota of patients with cystic fibrosis during early Pseudomonas aeruginosa colonization
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Springer Plus
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0.982
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2015
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5個囊性纖維化患者16–39 個月的20個痰樣本
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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Composition and dynamics of the respiratory tract microbiome in intubated patients
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Microbiome
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9.0
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2016
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15個呼吸衰竭受試者的上呼吸道口咽和深部氣管分泌物樣本
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細菌16S rDNA V6區(qū)測序
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Dysbiosis of upper respiratory tract microbiota in elderly pneumonia patients
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The ISME Journa
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9.328
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2016
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100位年齡》60歲的老年肺炎患者，27位年齡18歲-60歲的青年肺炎患者；91位健康的老年人和187位健康的青年人的口咽樣本
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細菌16S rDNA V5-V7區(qū)測序
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生殖道疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Temporal and spatial variation of the human microbiota during pregnancy
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PNAS
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9.423
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2015
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49名18歲及以上的孕婦每一周以及產(chǎn)后的陰道、大便、唾液和牙齒/牙齦樣本
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細菌16S rDNA擴增子測序
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Cervicovaginal Bacteria Are a Major Modulator of Host Inflammatory Responses in the Female Genital Tract
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Immunity
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24.082
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2015
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94個無癥狀婦女陰道陰道棉簽擦拭樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)擴增子測序
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Metabolicsignatures of bacterial vaginosis
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mBIO
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6.786
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2015
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40個健康女性和20個細菌性陰道炎患者的聚氨酯泡沫拭子、陰道灌洗液、子宮頸灌洗液
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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口腔疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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A Filifactor alocis-centered co-occurrence group associates with periodontitis across different oral habitats
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Scientific Reports
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5.228
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2015
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牙周炎患者和健康志愿者的唾液，牙齦上菌斑，牙齦下菌斑樣品
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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Prediction of Early Childhood Caries via Spatial-Temporal Variations of Oral Microbiota
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Cell Host & Microbe
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12.552
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2015
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未患齲齒兒童；患有輕微齲齒兒童；患有嚴重齲齒兒童的唾液和牙菌斑樣品
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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Cigarette smoking and the oral microbiome in a large study of American adults
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The ISME Journal
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9.328
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2016
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從未吸過煙的志愿者；有過吸煙史但已戒煙的志愿者；一直吸煙志愿者的口腔樣本
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序
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皮膚疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Topographic persity of fungal and bacterial communities in human skin
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Nature
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38.138
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2013
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十位健康成年人身上收集的易發(fā)生真菌性皮膚病的十四個皮膚部位拭子樣本
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細菌16S rDNA V3-V4區(qū)測序；真菌18SrDNA V1-V6區(qū)擴增子測序，；真菌ITS1擴增子測序
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Intestinal microbiome analyses identify melanoma patients at risk for checkpoint-blockade-induced colitis
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Nature communications
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11.329
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2016
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34名患黑色素瘤并且接受依普利姆瑪治療的病人糞便樣本（24名沒有患腸炎；10名患腸炎組）
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細菌16S rDNA V4-V5區(qū)測序
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免疫性疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Decreased Bacterial Diversity Characterizes the Altered Gut Microbiota in Patients With Psoriatic Arthritis, Resembling Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease
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Arthritis Rheumatol
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6.009
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2015
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17個銀屑病關節(jié)炎患者，15個牛皮癬患者，17個健康志愿者糞便樣品
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細菌16S rDNA V1-V2區(qū)測序；
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Intestinal Dysbiosis in Ankylosing Spondylitis
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Arthritis Rheumatol
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6.009
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2015
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9個強直性脊柱炎患者，9個健康對照的糞便樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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心腦血管疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Human oral, gut, and plaque microbiota in patients with atherosclerosis
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PNAS
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9.423
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2015
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15個正常人和15個動脈粥樣硬化患者的動脈粥樣硬化斑塊，腸道，口腔樣本
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細菌16S rDNA V1-V2區(qū)測序
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Microbiota Dysbiosis Controls the Neuroinflammatory Response after Stroke
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The Journal of Neuroscience
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5.924
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2016
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誘導中風小鼠和正常小鼠的糞便樣本
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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Commensal microbiota affects ischemic stroke outcome by regulating intestinal γδ T cells
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Nature medicine
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30.357
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2015
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利用抗生素清除腸道微生物后的小鼠和一組對照小鼠的糞便樣本，然后中風誘導
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細菌16S rDNA V4-V5區(qū)測序
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神經(jīng)性疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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Reduced diversity and altered composition of the gut microbiome in individuals with myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome
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Microbiome
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9.0
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2016
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48例肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征患者和39例對照受試者的糞便樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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Reduced incidence of Prevotella and other fermenters in intestinal microflora of autistic children
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Plos one
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3.057
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2013
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20名正常人和20個自閉癥兒童的糞便樣品
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細菌16S rDNA V2-V3區(qū)測序
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Fecal microbiota and metabolome of children with autism and pervasive developmental disorder not otherwise specified
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Plos one
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3.057
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2013
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10名廣泛性發(fā)展障礙兒童，10名自閉癥兒童和10名正常兒童糞便樣本
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細菌16S rDNA V1-V3區(qū)測序
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乳腺癌
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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The Microbiome of Aseptically Collected Human Breast Tissue in Benign and Malignant Disease
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Scientific Reports
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5.228
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2016
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乳腺癌患者和良性腫瘤的乳腺組織，乳房皮膚組織，乳房皮膚和口腔黏膜樣品
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細菌16S rDNA V3-V5區(qū)測序
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The microbiota of breast tissue and its association with tumours
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Appl.Environ. Microbiol.
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3.823
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2016
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乳腺癌患者癌旁正常組織和健康對照組的組織
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細菌16S rDNA V6區(qū)測序
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代謝類疾病
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英文題目
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期刊名稱
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影響因子
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發(fā)表時間
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實驗樣品
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測序策略
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A core gut microbiome in obese and lean twins
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Nature
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38.138
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2009
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胖瘦不同的同卵雙胞胎（31對）、異卵雙胞胎（23對）及其母親（46個）的糞便樣本
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細菌16S rDNA V2,V6區(qū)測序
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Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
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Plos one
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3.057
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2010
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Ⅱ型糖尿病男性患者18人，正常男性18人的糞便樣本
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細菌16S rDNA V4-V6區(qū)測序
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Fecal microbiota imbalance in Mexican children with type 1 diabetes
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Scientific Reports
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5.228
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2014
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8 例健康兒童，8 例初發(fā) I 型糖尿病患者，
以及 13 例已治療兩年的 I 型糖尿病患者的糞便樣本
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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The stool microbiota of insulin resistant women with recent gestational diabetes, a high risk group for type 2 diabetes
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5.228
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2015
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分娩3-16個月后的42名妊娠期糖尿病患者和35名健康者糞便樣品
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細菌16S rDNA V4區(qū)測序
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相信看完這些文章集錦給各領域的您已經(jīng)帶來思路上的啟發(fā)，但是下一步的擴增子測序又怎么能缺少天昊生物呢，來看看我們擴增子測序絕對任性的服務吧?。。?/span>
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