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圖1. Illumina GAIIx

高速基因分析系統(tǒng)GAIIx(Solexa)測(cè)序是一種基于單分子簇的邊合成邊測(cè)序技術(shù)，它基于專有的可逆終止化學(xué)反應(yīng)原理。2006年Solexa公司被Illumina公司收購(gòu)，后被重新命名為Illumina Genome Analyzer。作為新一代分子生物學(xué)綜合技術(shù)平臺(tái)，Genome Analyzer測(cè)序技術(shù)避免了像傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)那樣耗費(fèi)大量人力、物力進(jìn)行片段克隆、轉(zhuǎn)化、質(zhì)粒抽提等工作，具有高準(zhǔn)確性，高通量，高靈敏度，低運(yùn)行成本等突出優(yōu)勢(shì)，是目前市場(chǎng)占有率最高的第二代高通量基因測(cè)序儀。

測(cè)序原理：
測(cè)序時(shí)將基因組DNA的隨機(jī)片段附著到光學(xué)透明的玻璃表面（即Flow cell），這些DNA片段經(jīng)過(guò)延伸和橋式擴(kuò)增后，在Flow cell上形成了數(shù)以億計(jì)Cluster，每個(gè)Cluster是具有數(shù)千份相同模板的單分子簇。然后利用帶熒光基團(tuán)的四種特殊脫氧核糖核苷酸，通過(guò)可逆性終止的SBS（邊合成邊測(cè)序）技術(shù)對(duì)待測(cè)的模板DNA進(jìn)行測(cè)序。這種新方法確保了高精確度和真實(shí)的一個(gè)堿基接一個(gè)堿基的測(cè)序，排除序列方面的特殊錯(cuò)誤，為同聚物和重復(fù)序列的測(cè)序提供了一個(gè)很好的解決方案。

性能特點(diǎn)：
• 測(cè)序通量高：每個(gè)測(cè)序反應(yīng)能達(dá)到90G以上的數(shù)據(jù)通量；
• 準(zhǔn)確率高： ≥ 98.5%，同時(shí)也有效地解決了多聚重復(fù)序列的讀取問(wèn)題；
• 低成本：比傳統(tǒng)毛細(xì)管測(cè)序技術(shù)成本的1%還低；
• DNA序列的讀取長(zhǎng)度不斷增加，當(dāng)前達(dá)到300 bp；
• 可以進(jìn)行Pair-End雙向測(cè)序，目前Pair-End文庫(kù)插入片段大小范圍可由200bp到10kb；
• 每張芯片有8個(gè)通道，每個(gè)通道可單獨(dú)測(cè)序一個(gè)樣品，也可以把多個(gè)樣品混合在一起測(cè)序。

應(yīng)用領(lǐng)域：
• 全基因組測(cè)序（重測(cè)序）
• BAC重測(cè)序
• 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
• 宏基因組測(cè)序
• 基因表達(dá)譜
• 小RNA測(cè)序
• ChIP-Seq測(cè)序

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Illumina GAIIx