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天昊生物測序再創(chuàng)佳績:助力客戶登陸Nature

 
天昊生物測序服務再創(chuàng)佳績:助力客戶登陸Nature子刊
    近日,天昊生物Illumina Hiseq2000和Miseq測序服務技術平臺,助力上海交通大學附屬第六人民醫(yī)院血液內科李曉教授課題組,在骨髓增生異常綜合征(MyelodysplasticSyndrome,MDS)疾病進展相關的驅動因子研究中取得重要進展。研究團隊采用全外顯子及目的區(qū)域測序技術鑒別出了ROBO1和ROBO2突變,揭示了ROBO1和ROBO2基因在MDS疾病中的腫瘤生物學定義,證實了ROBO1突變可作為疾病進展的監(jiān)測指標。相關研究成果近日發(fā)表在著名學術期刊Nature Communications《自然通訊》(IF=11.47),文章題目為“Whole-exome and targeted sequencing identify ROBO1 and ROBO2 mutations as progression-related drivers in myelodysplasticsyndromes”。
 
研究背景
    骨髓增生異常綜合征(MDS)是一類造血系統(tǒng)腫瘤性疾病,起源于惡性造血干/祖細胞、具有明顯的異質性。其特點是髓系細胞分化及發(fā)育異常,表現(xiàn)為無效造血、難治性血細胞減少、造血功能衰竭,高達30%的MDS患者會向急性髓系白血?。ˋML)轉化。MDS疾病進展是影響患者生存時間的重大威脅,如何精準的評估MDS患者的疾病進展是一個研究難題,目前正迫切需要確定促進MDS疾病進展的特異分子事件(驅動事件)。近年來,NGS及NES測序技術已成功鑒別部分MDS進展相關突變,如ASXL1、RUNX1、TET2、IDH1、IDH2 和SETBP1突變,但這些與疾病進展相關的突變仍有待驗證。
 
研究方法

圖注:外顯子測序與目的區(qū)域測序研究思路
    李曉教授課題組首先對3名配對疾病進展患者的系列骨髓樣本進行了全外顯子組和目的區(qū)域測序,試圖發(fā)現(xiàn)與疾病進展相關的體細胞突變。外顯子組測序共發(fā)現(xiàn)了26個候選突變基因,并且發(fā)現(xiàn)1例病人存在ROBO1體細胞突變,另 1例病人存在ROBO2體細胞突變。通過對26個篩查到的候選基因和前期發(fā)現(xiàn)的13個MDS候選基因進行目的區(qū)域捕獲測序,最終,在16名配對患者中,有6名(37.5%)患者存在ROBO1和ROBO2體細胞突變,即是新的疾病進展相關體細胞突變。通過對包含193名MDS患者進行進一步的深度測序,檢測出20名(10.4%)患者具有ROBO突變。此外,在疾病進展或攜帶ROBO突變的患者中頻繁觀察到有ROBO1和ROBO2存在CNV及雜合度丟失(LOH)。ROBO1突變的患者呈現(xiàn)明顯縮短的生存時間及增加的白血病轉化風險。
在體外實驗中,研究人員證實ROBO1和ROBO2是一個抑癌基因,ROBO1或ROBO2突變導致的ROBO/SLIT2信號失活可能推動疾病進展。
圖注:26例具有ROBOR突變MDS患者的突變譜
結論
    以上研究結果證實了ROBO突變對MDS發(fā)病機制的貢獻,首次鑒定了ROBO1/2突變是MDS疾病進展的驅動突變,豐富了MDS的突變譜,為研究MDS的疾病進展機制及拓展相應的靶向治療提供了新的策略。
 
特別感謝
    天昊生物特別感謝上海交通大學附屬第六人民醫(yī)院血液內科李曉教授課題組對天昊生物技術服務的認可,感謝李曉教授課題組在上海交大醫(yī)學院新聞網(wǎng)對天昊生物合作支持的認可。上海天昊生物將一直作為專業(yè)、認真、嚴謹?shù)臏y序服務提供商,助力廣大科研工作者!



上海交大醫(yī)學院新聞網(wǎng)李曉研究組新成果鏈接:http://news.shsmu.edu.cn/default.php?mod=article&do=detail&tid=1019284#rd&sukey=fc78a68049a14bb20b0240b5ad0b7cdb6f063ee6dad20d85677d9bf75043489715018e366f2cf5767a3bec2850fd0c30
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